Το 1996 στην Ατλάντα ήταν η πρώτη φορά που συμμετείχαν στους Παραολυμπιακούς Αγώνες οι καλύτεροι αθλητές με νοητική υστέρηση. Στην κατηγορία αυτή, προκειμένου να συμμετέχει ένας αθλητής στους Παραολυμπιακούς, απαιτούνταν να έχει νοητικό πηλίκο κάτω απο 70 μονάδες.

Η σαρωτική νίκη στην καλαθοσφαίριση (μπάσκετ) της ομάδας της Ισπανίας, το 2000 στο Σύνδεϊ, αντικαταστάθηκε με αφαίρεση του τίτλου, όταν η Ισπανική Ολυμπιακή Επιτροπή ανακάλυψε, ότι μόνο δέκα από τους δώδεκα αθλητές που συμμετείχαν είχαν νοητική υστέρηση. Το σκάνδαλο, που δημιουργήθηκε, κόστισε βαριά στον χώρο του Αθλητισμού των Ατόμων με Αναπηρία. Η Διεθνής Ολυμπιακή Επιτροπή (ΔΟΕ) απαγόρευσε τη συμμετοχή ατόμων με νοητική υστέρηση στους Παραολυμπιακούς Αγώνες, με το σκεπτικό, ότι είναι δύσκολη η εκτίμηση του βαθμού της αναπηρίας. 

Η επιστημονική κοινότητα και παράγοντες του Αθλητισμού βρίσκονται ακόμα σε διαπραγματεύσεις με τη ΔΟΕ, ως προς αυτή την απόφαση. 

Special Olympics 

Οι Παραολυμπιακοί Αγώνες είναι διαφορετική διοργάνωση από τα Special Olympics, όπου συμμετέχουν αθλητές με νοητική υστέρηση με αποκλειστικό σκοπό τη συμμετοχή για την απόκτηση εμπειριών. Στους Παραολυμπιακούς Αγώνες συμμετέχουν παγκόσμιοι πρωταθλητές, αθλητές με υψηλό αγωνιστικό φρόνιμα και κύριο μέλημα το πάθος για διάκριση. Οι αθλητές των Παραολυμπιακών Αγώνων όπως και στους Ολυμπιακούς Αγώνες είναι απαραίτητο να "πιάσουν" τα όρια συμμετοχής για να έχουν το δικαίωμα να συμμετέχουν στους Αγώνες.

Οι Special Olympics δημιουργήθηκαν το 1968 από τον Eunice Kennedy Shriver, υποδιευθυντής του Ιδρύματος Joseph P. Kennedy Jr. To 1988 οι Ολυμπιακοί Αγώνες αναγνωρίστηκαν από την Διεθνή Ολυμπιακή Επιτροπή (ΔΟΕ), αποτελώντας με αυτόν τον τρόπο τη μοναδική αθλητική διοργάνωση που έχει εξουσιοδοτηθεί από την ΔΟΕ να χρησιμοποιεί τον τίτλο "Ολυμπιακός". Το 1988 γιόρταζαν τα εικοστά γενέθλια τους. Σήμερα, η συμμετοχή στους Special Olympics φτάνει τους ένα εκατομύριο αθλητές σε 153 χώρες παγκοσμίως. Διαβάστε περισσότερα για τα Special Olympics (Σπέσιαλ Ολύμπικς) από το NOESI.gr στη σελίδα http://noesi.gr/specialolympics.

Αθλητές με κώφωση 

Οι άνθρωποι με κώφωση δε συμμετέχουν στους Παραολυμπιακούς. Ωστόσο, έχουν τους δικούς τους Αγώνες, τους Κωφωολυμπιακούς (Deaflympics!) που διοργανώνονται εξ ολοκλήρου ξεχωριστά.